斑鳠,俗名白須魽、芝麻魽,是“珠江四鮮”之一,因其肉質鮮嫩、營養價值高而市場需求旺盛。然而,由于過度捕撈和生態環境惡化,野外群體數量銳減,已于2021年被列入《國家重點保護水生野生動物名錄》二級。目前,斑鳠的全人工繁殖與規模化苗種培育技術仍存在瓶頸,在種質資源鑒定、優良性狀選育及遺傳多樣性管理等方面缺乏高效的技術支撐。因此,開發液相基因芯片這種高效、精準的分子工具,可用于快速篩選具有優良性狀的親本、進行家系鑒定以避免近親繁殖,并監測種群多樣性,從而為斑鳠這一物種的可持續發展和野外種群的保護提供較好的技術基礎。
在國家淡水水產種質庫和佛山市南海國家現代農業產業園等項目支持下,珠江所牟希東研究員團隊利用靶向捕獲測序技術,成功開發了120252個SNP標記的斑鳠100K液相基因芯片,位點間平均距離為6100bp,完整覆蓋整個基因組。該款斑鳠全基因組SNP液相芯片為具有完全自主知識產權的分子標識產品,具備覆蓋基因組范圍廣、通用性強、適用性高等優勢,可廣泛應用于斑鳠的基因型鑒定、物種親緣關系分析、種群結構解析、種質資源多樣性評估、功能基因挖掘以及遺傳育種等多個研究方向。該芯片在保持高準確性且不顯著縮小檢測范圍的前提下,顯著縮短了基因型檢測周期,并大幅降低了檢測成本,為斑鳠的繁殖、種質資源保護及遺傳多樣性評估提供了高效、可靠的技術支撐。

圖1.斑鳠

圖2. 基因芯片

圖3.基因組分布圖